昔、何かの雑誌のコラムで読んだうろ覚えで、ドイツ語由来とだけ記憶していました。
というわけで引用。
https://www.etymonline.com/word/kernel
"edible substance in a nut or the stone of a fruit," Old English cyrnel "seed, kernel, pip," from Proto-Germanic *kurnilo- (source also of Middle High German kornel "a grain," Middle Dutch cornel"coarse meal"), from the root of corn "seed, grain" (from PIE root *gre-no- "grain") + -el, diminutive suffix. Figurative sense of "core or central part of anything" is from 1550s.
ゲルマン祖語に由来。元々は、タネ。比喩として「中心部」という用法が16世紀からあるということですな。
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